Die Geschäftsstelle der BürgerStiftung Düsseldorf besteht aus drei hauptamtlich tätigen Mitarbeiterinnen, sowie einer Zeitstifterin, also ehrenamtlichen Mitarbeiterin. Zu ihren Aufgaben gehören die aktive Stiftungsarbeit und Zuarbeit des Vorstands, Aufstellung, Vollzug und Abschluss des Wirtschaftsplans der Stiftung und darüber hinaus die administrative Unterstützung der einzelnen Ressorts.