Die Geschäftsstelle der BürgerStiftung besteht aus Geschäftsführung und Assistenz. Zu den Aufgaben der Geschäftsführung gehören neben der Leitung der Geschäftsstelle aktive Stiftungsarbeit und Zuarbeit des Vorstands, Aufstellung, Vollzug und Abschluss des Wirtschaftsplans der Stiftung und darüber hinaus die administrative Unterstützung der einzelnen Ressorts.